试管婴儿过程中的激素治疗可能会催生情绪波动，部分女性可能出现焦虑、抑郁等心理问题。加之，治疗周期的不确定性、经济压力以及对结果的担忧，都可能加重心理负担。为了提高成功率，有时会在移植过程中植入多个胚胎，这增加了多胎妊娠的可能性。多胎妊娠不仅增加了孕妇的孕期并发症风险，如高血压、糖尿病等，还可能影响胎儿的健康，增加早产和低体重儿的风险。尽管罕见，但试管婴儿过程中仍存在宫外孕的风险。宫外孕是指受精卵着床在子宫以外的地方，最常见的是输卵管内。
宫外孕是一种紧急情况，需要及时医疗干预，否则可能危及生命。有研究表明，多次进行试管婴儿治疗可能与某些长期健康问题相关联，如卵巢癌的风险轻微增加。反过来说，这些研究结果并不一致，且大多数专家认为，试管婴儿本身并不会显著增加患癌风险。反之，长期的激素暴露是否会对女性健康产生其他潜在影响，仍需进一步研究。试管婴儿治疗费用较高，且通常不在基本医疗保险覆盖范围内，这给家庭带来了不小的经济压力。经济负担不仅会影响治疗的选择，还可能加剧心理压力。
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